Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HACE1Q8IYU2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HACE1Q8IYU2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms