Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC170Q8IYT3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC170Q8IYT3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms