Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACS2Q86VP3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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