Protein–RNA interactions for Protein: Q86VL8

SLC47A2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A2Q86VL8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC47A2Q86VL8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC47A2Q86VL8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms