Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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