Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIMS2Q7Z4I7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMS2Q7Z4I7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms