Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRADAQ7RTN6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRADAQ7RTN6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms