Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYS1Q717R9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CYS1Q717R9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYS1Q717R9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYS1Q717R9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYS1Q717R9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYS1Q717R9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYS1Q717R9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYS1Q717R9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms