Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP50Q70EL3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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