Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM136Q6ZRR5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM136Q6ZRR5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms