Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4orf50Q6ZRC1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4orf50Q6ZRC1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms