Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDZRN4Q6ZMN7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN4Q6ZMN7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms