Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CASC2Q6XLA1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CASC2Q6XLA1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms