Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMIGD1Q6UXZ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD1Q6UXZ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms