Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASC1Q6TDU7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC1Q6TDU7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms