Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TSSK4Q6SA08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK4Q6SA08 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms