Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC174Q6PII3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC174Q6PII3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms