Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R18Q6NYC8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R18Q6NYC8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms