Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD2Q6NTF9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDD2Q6NTF9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms