Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRC8EQ6NSJ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC8EQ6NSJ5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms