Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALS2CLQ60I27 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms