Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GGNBP1Q5YKI7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GGNBP1Q5YKI7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms