Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGAP9Q5VTM2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms