Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EEF1A1P5Q5VTE0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms