Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms