Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms