Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ZNF628Q5EBL2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms