Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BBS9Q3SYG4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms