Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
KRTAP20-2Q3LI61 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
KRTAP20-2Q3LI61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms