Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TYSND1Q2T9J0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TYSND1Q2T9J0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TYSND1Q2T9J0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms