Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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