Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLPPQ16740 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLPPQ16740 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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