Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.74e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RPL19-201ENST00000225430 732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.074e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RPL19-205ENST00000579374 690 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.074e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RPL19-203ENST00000577759 564 nt7.86□□□□□ -1.154e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 RPL19-202ENST00000577741 1303 ntTSL 26.8□□□□□ -1.324e-9■□□□□ 9.5
SRSF7Q16629 ARIH2-204ENST00000433170 560 ntTSL 415.86■□□□□ 0.132e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-218ENST00000474936 695 ntTSL 215.86■□□□□ 0.132e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-226ENST00000488963 517 ntTSL 315.86■□□□□ 0.132e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-202ENST00000420814 884 ntTSL 314.72□□□□□ -0.052e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-224ENST00000486316 406 ntTSL 414.72□□□□□ -0.052e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-227ENST00000490095 1001 ntTSL 514.72□□□□□ -0.052e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-230ENST00000495761 569 ntTSL 314.51□□□□□ -0.092e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-219ENST00000478224 507 ntTSL 313.69□□□□□ -0.222e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-206ENST00000449729 678 ntTSL 213.49□□□□□ -0.252e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-203ENST00000430423 753 ntTSL 212.57□□□□□ -0.42e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-231ENST00000498314 649 ntTSL 412.57□□□□□ -0.42e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-217ENST00000474618 566 ntTSL 312.49□□□□□ -0.412e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-221ENST00000482427 556 ntTSL 412.49□□□□□ -0.412e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-222ENST00000483333 674 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-208ENST00000452882 598 ntTSL 312.47□□□□□ -0.412e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-223ENST00000484999 728 ntTSL 511.58□□□□□ -0.562e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-213ENST00000466850 546 ntTSL 210.23□□□□□ -0.772e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-215ENST00000470296 457 ntTSL 1 (best)9.86□□□□□ -0.832e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.012e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-210ENST00000463204 522 ntTSL 58.23□□□□□ -1.092e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 ARIH2-207ENST00000452385 2778 ntTSL 28.09□□□□□ -1.112e-10■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-223ENST00000556277 891 ntTSL 513.47□□□□□ -0.252e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-231ENST00000557189 678 ntTSL 212.57□□□□□ -0.42e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-225ENST00000556743 1456 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.522e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-208ENST00000553756 656 ntTSL 310.98□□□□□ -0.652e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-204ENST00000465445 2554 ntTSL 510.89□□□□□ -0.672e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-206ENST00000553629 1301 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.692e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-205ENST00000535852 2471 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.712e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-203ENST00000460049 2672 ntTSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.712e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-234ENST00000557619 1004 ntTSL 210.33□□□□□ -0.762e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-209ENST00000554069 755 ntTSL 310.08□□□□□ -0.82e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-233ENST00000557482 728 ntTSL 510.08□□□□□ -0.82e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.82e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-220ENST00000555896 927 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.922e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-227ENST00000556943 747 ntTSL 38.75□□□□□ -1.012e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 AP1G2-210ENST00000554312 635 ntTSL 26.84□□□□□ -1.312e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.061e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-214ENST00000487615 4485 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.811e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-212ENST00000480461 538 ntTSL 1 (best)9.91□□□□□ -0.821e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-213ENST00000485530 839 ntTSL 29.91□□□□□ -0.821e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 59.55□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-208ENST00000465245 634 ntTSL 39.35□□□□□ -0.911e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-210ENST00000471134 724 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 TRA2B-211ENST00000477939 530 ntTSL 25.04□□□□□ -1.61e-8■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.77e-7■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.387e-7■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.447e-7■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 CLTC-205ENST00000472651 665 ntTSL 24.02□□□□□ -1.777e-7■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 CLTC-209ENST00000498711 2941 ntTSL 1 (best)3.39□□□□□ -1.877e-7■□□□□ 9.4
SRSF7Q16629 HNRNPA1-205ENST00000547566 1234 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.592e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CRACR2B-205ENST00000527763 1728 ntTSL 222.8■■□□□ 1.247e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.817e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CRACR2B-210ENST00000530688 1623 ntTSL 219.24■□□□□ 0.677e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.647e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)18.71■□□□□ 0.597e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CRACR2B-208ENST00000528694 2440 ntTSL 218.68■□□□□ 0.587e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.227e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 415.69■□□□□ 0.14e-15■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.077e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 NPEPL1-205ENST00000527081 2061 ntTSL 215.25■□□□□ 0.037e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.027e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CRACR2B-203ENST00000526531 714 ntTSL 314.83□□□□□ -0.047e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 DIS3L-213ENST00000565281 2305 ntTSL 512.22□□□□□ -0.457e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 DIS3L-204ENST00000525109 873 ntTSL 311.96□□□□□ -0.497e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.517e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 211.84□□□□□ -0.517e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 DIS3L-211ENST00000564909 2399 ntTSL 210.92□□□□□ -0.667e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.687e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CSF3R-202ENST00000361632 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.87e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CSF3R-210ENST00000480825 6074 ntTSL 29.59□□□□□ -0.877e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.967e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 DIS3L-202ENST00000319212 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.987e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ACTN4-209ENST00000586538 546 ntTSL 58.76□□□□□ -1.017e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 57.88□□□□□ -1.157e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 DIS3L-201ENST00000319194 3763 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.167e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.27e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.427e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 DIS3L-203ENST00000524795 1504 ntTSL 26.07□□□□□ -1.447e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ERBIN-211ENST00000507490 337 ntTSL 35.81□□□□□ -1.487e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 45.51□□□□□ -1.534e-15■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 35.51□□□□□ -1.534e-15■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 25.29□□□□□ -1.569e-10■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 44.25□□□□□ -1.734e-15■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 DIS3L-205ENST00000525134 327 ntTSL 33.71□□□□□ -1.827e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.97e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.937e-6■□□□□ 9.3
SRSF7Q16629 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.997e-6■□□□□ 9.3
Retrieved 100 of 5,030 protein–RNA pairs in 109.9 ms