Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFE2Q16621 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFE2Q16621 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms