Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNCBQ16143 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNCBQ16143 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms