Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP3Q15836 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VAMP3Q15836 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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