Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TAF1AQ15573 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1AQ15573 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1AQ15573 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TAF1AQ15573 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1AQ15573 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1AQ15573 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1AQ15573 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1AQ15573 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1AQ15573 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TAF1AQ15573 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TAF1AQ15573 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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