Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CNN3Q15417 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CNN3Q15417 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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