Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TLR1Q15399 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TLR1Q15399 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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