Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HDM1Q15032 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
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