Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCAPD2Q15021 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCAPD2Q15021 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms