Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERPUD1Q15011 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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