Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ODF1Q14990 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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ODF1Q14990 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ODF1Q14990 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ODF1Q14990 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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ODF1Q14990 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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