Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNIQ14094 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNIQ14094 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms