Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA1SQ13698 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1SQ13698 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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