Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CUL3Q13618 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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CUL3Q13618 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CUL3Q13618 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CUL3Q13618 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL3Q13618 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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