Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C1orf61Q13536 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C1orf61Q13536 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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