Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 28
PABPC4Q13310 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 28
PABPC4Q13310 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 28
PABPC4Q13310 PSMA1-207ENST00000528307 1394 ntTSL 57.37□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 28
PABPC4Q13310 CISD1-201ENST00000333926 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 28
PABPC4Q13310 CISD1-202ENST00000464703 698 ntTSL 55.25□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 28
PABPC4Q13310 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 NDUFAB1-203ENST00000562133 503 ntTSL 218.6■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 NDUFAB1-202ENST00000484769 843 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-223ENST00000459783 694 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 BRMS1-207ENST00000530238 1817 ntTSL 525.32■■□□□ 1.643e-6■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 BRMS1-203ENST00000524699 1131 ntTSL 318.25■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 SREBF2-208ENST00000491541 4043 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.646e-8■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 27.9
PABPC4Q13310 MVK-203ENST00000447878 1644 ntTSL 228.87■■■□□ 2.213e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.923e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 MVK-216ENST00000636996 1725 ntTSL 520.73■□□□□ 0.913e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 MVK-215ENST00000636529 1509 ntTSL 519.53■□□□□ 0.723e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.243e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 MVK-209ENST00000540353 4109 ntTSL 211.49□□□□□ -0.573e-9■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.412e-17■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.293e-8■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.983e-8■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.433e-8■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-6■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 CENPL-201ENST00000345664 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 FIS1-209ENST00000482199 731 ntTSL 320.65■□□□□ 0.94e-11■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 FIS1-205ENST00000463406 527 ntTSL 311.21□□□□□ -0.614e-11■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.618e-12■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.258e-12■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.198e-12■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.054e-11■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.024e-11■■■■■ 27.8
PABPC4Q13310 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.352e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.752e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.612e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-203ENST00000367375 996 ntTSL 514.56□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-211ENST00000433252 1096 ntTSL 214.51□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-215ENST00000465806 2610 ntTSL 214.46□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-221ENST00000475977 794 ntTSL 313.81□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 WDR45-225ENST00000486337 422 ntTSL 511.32□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.899e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 MYEOV-205ENST00000535653 2468 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.59e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 MYEOV-211ENST00000544008 599 ntTSL 215.46■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 RFC5-201ENST00000392542 2449 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 RFC5-209ENST00000543153 1061 ntTSL 512.32□□□□□ -0.442e-11■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 RPS17-210ENST00000561440 1922 ntTSL 218.55■□□□□ 0.562e-31■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 RPS17-206ENST00000560612 1877 ntTSL 28.66□□□□□ -1.022e-31■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 RPS17-208ENST00000561068 522 ntTSL 35.7□□□□□ -1.52e-31■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 27.7
PABPC4Q13310 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.471e-8■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 GUSB-205ENST00000447929 1983 ntTSL 327.86■■■□□ 2.051e-8■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 GUSB-203ENST00000430730 1859 ntTSL 527.61■■■□□ 2.011e-8■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-8■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 GUSB-209ENST00000466883 2555 ntTSL 217.02■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 58.98□□□□□ -0.972e-50■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.851e-10■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-10■■■■■ 27.6
PABPC4Q13310 SNW1-201ENST00000261531 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 27.5
PABPC4Q13310 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.259e-8■■■■■ 27.5
PABPC4Q13310 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.238e-12■■■■■ 27.5
PABPC4Q13310 HSPBP1-207ENST00000587959 424 ntTSL 528.39■■■□□ 2.148e-12■■■■■ 27.5
PABPC4Q13310 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.978e-12■■■■■ 27.5
PABPC4Q13310 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.848e-12■■■■■ 27.5
PABPC4Q13310 FHL2-211ENST00000530340 1876 ntTSL 1 (best)26.13■■□□□ 1.778e-12■■■■■ 27.5
PABPC4Q13310 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.58e-12■■■■■ 27.5
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