Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
PRDM2Q13029 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
PRDM2Q13029 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PRDM2Q13029 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
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