Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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RAB40BQ12829 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RAB40BQ12829 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RAB40BQ12829 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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RAB40BQ12829 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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RAB40BQ12829 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB40BQ12829 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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